140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0509 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  99.36 
 
 		 312 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  99.04 
 
 		 312 aa  634    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  99.04 
 
 		 312 aa  634    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  99.04 
 
 		 312 aa  634    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 312 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 		 312 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  99.04 
 
 		 312 aa  634    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 		 312 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 		 312 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 		 312 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  99.04 
 
 		 312 aa  634    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 		 312 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 312 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 		 312 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  82.37 
 
 		 261 aa  502  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  81.73 
 
 		 261 aa  478  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  57.73 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  57.73 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  57.73 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  57.73 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  57.73 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  57.73 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1621  hypothetical protein  33.77 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  33.55 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  33.55 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  33.55 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  31.36 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  31.36 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  32.89 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  32.89 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  34.35 
 
 		 253 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  32.23 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  26.57 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  26.57 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  26.57 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  26.57 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  35.37 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  35.37 
 
 		 186 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  34.62 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  30.18 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  22.94 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  29.41 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  27.32 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  25 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  22.84 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  22.84 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  22.84 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  26.96 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  27.32 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  26.96 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  27.59 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  26.47 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  26.83 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  26.83 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  26.83 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  22.71 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  28.79 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  22.39 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  22.38 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  22.71 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  24.51 
 
 		 238 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  26.89 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  27.96 
 
 		 218 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  25.65 
 
 		 237 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  21.89 
 
 		 237 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  24.75 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 		 156 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  24.75 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  24.75 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  24.75 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  26.76 
 
 		 255 aa  52.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  25 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  24.75 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  24.75 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  22.33 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  26.67 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 156 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  26.67 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  26.67 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  21.84 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  22.66 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  24.02 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  21.84 
 
 		 236 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  23.45 
 
 		 232 aa  49.3  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  26.07 
 
 		 264 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  26.07 
 
 		 254 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  26.07 
 
 		 254 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  25.46 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  25.46 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  25.46 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  25.46 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>