144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0422 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  99.68 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  100 
 
 
312 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  99.04 
 
 
312 aa  634    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  99.36 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  100 
 
 
312 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  99.36 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  99.36 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  99.36 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  99.68 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  99.36 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  99.04 
 
 
312 aa  634    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  99.36 
 
 
312 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  83.01 
 
 
261 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  81.41 
 
 
261 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
316 aa  361  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
316 aa  361  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
316 aa  361  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
316 aa  361  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
316 aa  361  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
316 aa  361  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1621  hypothetical protein  33.77 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  33.89 
 
 
340 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  33.89 
 
 
340 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  33.89 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 
253 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 
340 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  26.87 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  26.87 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  26.87 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  26.87 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  26.63 
 
 
353 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  26.63 
 
 
353 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  26.63 
 
 
353 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  26.63 
 
 
353 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  26.63 
 
 
353 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  26.63 
 
 
353 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  26.63 
 
 
353 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  30.77 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  30 
 
 
180 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  23.38 
 
 
238 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  27.8 
 
 
233 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  25.47 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  27.45 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  23.35 
 
 
238 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  23.35 
 
 
238 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  23.35 
 
 
238 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  27.8 
 
 
233 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  27.45 
 
 
238 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  28.08 
 
 
237 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  27.32 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  27.32 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  27.32 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  26.96 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  23.19 
 
 
236 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
137 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  22.89 
 
 
237 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  22.86 
 
 
224 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  28.28 
 
 
233 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  23.19 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  25 
 
 
238 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  27.36 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  25.25 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  25.25 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  25.25 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  25.25 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  26.18 
 
 
237 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  22.39 
 
 
237 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  27.23 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  27.49 
 
 
218 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
156 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  25.25 
 
 
242 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  22.79 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  25.25 
 
 
242 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  25.49 
 
 
238 aa  52.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  22.33 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  23.15 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  27.27 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  27.27 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  27.27 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  22.33 
 
 
236 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  24.51 
 
 
238 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  23.89 
 
 
232 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  26.54 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  26.54 
 
 
254 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  26.54 
 
 
254 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  25.93 
 
 
240 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  25.93 
 
 
240 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  25.93 
 
 
240 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  25.93 
 
 
240 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>