More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0947 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  98.53 
 
 		 340 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  98.24 
 
 		 340 aa  700    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  98.53 
 
 		 340 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  99.12 
 
 		 340 aa  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 340 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  97.94 
 
 		 340 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  97.94 
 
 		 340 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  97.35 
 
 		 340 aa  690    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  98.42 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 		 186 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  50.44 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  47.41 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  47.41 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  47.41 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  47.41 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  46.84 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  46.84 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  46.84 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  46.84 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  46.84 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  46.84 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  46.84 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  98.71 
 
 		 156 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  96.15 
 
 		 156 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  98.68 
 
 		 152 aa  315  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 		 137 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1472  hypothetical protein  96.15 
 
 		 78 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.380106  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  30.42 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  30.42 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  30.42 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  30.42 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  30.42 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  30.42 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  33.22 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  33.22 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  33.22 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  33.22 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  32.89 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  32.89 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  35.91 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  23.53 
 
 		 478 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  23.53 
 
 		 478 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  23.53 
 
 		 478 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  23.26 
 
 		 470 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  30.58 
 
 		 233 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  29.1 
 
 		 235 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  33.67 
 
 		 261 aa  87.4  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  33.67 
 
 		 261 aa  86.7  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  37.09 
 
 		 180 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  32.61 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  32.12 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  35.33 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  32.12 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  32.12 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  32.12 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  32.12 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  35.33 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  32.12 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  32.12 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  29.07 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  29.1 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  29.33 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  35.33 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  32.12 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  30.43 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  32.12 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  29.1 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  30.26 
 
 		 251 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  35.33 
 
 		 237 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  32.12 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  32.12 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  30.43 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  30.43 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  30.81 
 
 		 234 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  32.12 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>