45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1472 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1472  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.380106  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  97.44 
 
 		 340 aa  157  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  97.44 
 
 		 340 aa  157  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  97.44 
 
 		 340 aa  157  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  96.15 
 
 		 340 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  96.15 
 
 		 340 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  96.15 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  93.59 
 
 		 340 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  93.59 
 
 		 340 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  94.87 
 
 		 340 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  96.1 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  96.61 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  61.33 
 
 		 343 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  31.82 
 
 		 478 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  31.82 
 
 		 478 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  31.82 
 
 		 478 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  31.82 
 
 		 470 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 319 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  43.1 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  43.1 
 
 		 178 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  41.38 
 
 		 251 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  41.38 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  41.38 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  36.21 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  41.07 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  41.07 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  41.07 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  41.07 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  41.07 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  39.66 
 
 		 269 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  37.93 
 
 		 280 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  36.21 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>