More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0576 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  99.24 
 
 		 393 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  100 
 
 		 393 aa  791    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  47.69 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 		 388 aa  292  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 333 aa  292  9e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  36.91 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 		 311 aa  203  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  36.84 
 
 		 319 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  32.15 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  33.06 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 374 aa  185  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 		 293 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  28.5 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  32.16 
 
 		 411 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 		 293 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  29.33 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  29.33 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.29 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  29.29 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  29.29 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  29.29 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  29.29 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  29.29 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  29.29 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.67 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  31.22 
 
 		 285 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  26.4 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  24.31 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  26.79 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  25.6 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 		 303 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  31.17 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 		 289 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  25.34 
 
 		 301 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  26.62 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  31.58 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  31.58 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.58 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.58 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  31.58 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  31.58 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  30.77 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  24.67 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  24.11 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  27.11 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  31.17 
 
 		 297 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  27.44 
 
 		 295 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  25.85 
 
 		 295 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1042  Co/Zn/Cd cation transporter  29.41 
 
 		 398 aa  106  9e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0463512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  27.8 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  26.06 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  23.63 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  25.62 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  25.62 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  25.9 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  25.62 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  27.76 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  25.54 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  26.9 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  26.5 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  24.55 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  24.55 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  24.55 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  24.55 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  24.55 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  24.55 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  25.55 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  24.55 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  24.55 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  24.57 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.71 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  25.09 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>