More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1008 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  90.96 
 
 		 390 aa  695    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 387 aa  783    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  88.89 
 
 		 387 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  87.86 
 
 		 387 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  86.62 
 
 		 396 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  85.86 
 
 		 399 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  62.98 
 
 		 385 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  62.98 
 
 		 385 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  62.63 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  64.18 
 
 		 385 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  62.63 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  65.08 
 
 		 395 aa  471  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  85.5 
 
 		 269 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  60.61 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  60.1 
 
 		 394 aa  438  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  66.42 
 
 		 299 aa  342  8e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  43.39 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  43.39 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1479  ISCpe4, transposase  85 
 
 		 166 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000438006  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  33.42 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  34.1 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  34.1 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  34.1 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  34.1 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  34.1 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.51 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  34.63 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  32.82 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  32.82 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  34.79 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  32.56 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  34.19 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  35.53 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  35.86 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.6 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  35.08 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  35.42 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  33.68 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  33.68 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  34.96 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  35.34 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  35.08 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  35.51 
 
 		 373 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.82 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  31.6 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.82 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.82 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.82 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  31.6 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  31.6 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  34.82 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3471  IS605 family transposase  33.59 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155497  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  35.34 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  32.55 
 
 		 450 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  32.55 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3745  IS605 family transposase  33.59 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0235026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3700  transposase, IS605 family  33.59 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000048938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  32.99 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3437  IS605 family transposase  33.59 
 
 		 370 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  32.08 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  32.08 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  31.36 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  32.08 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  31.17 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2896  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 		 370 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  33.51 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  33.16 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2865  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.85 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.931396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  33.16 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  33.16 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  33.16 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  31.36 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  31.36 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  33.85 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  31.11 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  34.11 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  34.39 
 
 		 383 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  34.03 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.9 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  31.23 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  34.13 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  30.37 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  31.11 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  34.11 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  33.33 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  31.11 
 
 		 402 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  33.59 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  33.85 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  37.98 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  32.55 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  30.86 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  30.97 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  30.26 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>