More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02690 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02690  ATP-dependent RNA helicase, putative  100 
 
 
748 aa  1535    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03176  ATP-dependent rRNA helicase spb4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F4]  37.98 
 
 
638 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.541811  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62830  ATP dependent RNA helicase  34.98 
 
 
617 aa  342  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0490658 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  35.52 
 
 
583 aa  299  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0224275 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9989  predicted protein  35.87 
 
 
620 aa  282  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860977  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  29.7 
 
 
765 aa  203  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  33.48 
 
 
808 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 
607 aa  188  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  29.07 
 
 
485 aa  188  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  33.73 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  34.26 
 
 
465 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  29.66 
 
 
812 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  30.13 
 
 
609 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  29.38 
 
 
567 aa  181  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  28.01 
 
 
627 aa  180  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  32.67 
 
 
484 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  29.93 
 
 
672 aa  175  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  27.74 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  32.77 
 
 
814 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  28.04 
 
 
589 aa  172  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  32.85 
 
 
396 aa  171  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  31.67 
 
 
466 aa  171  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  32.08 
 
 
433 aa  171  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04903  ATP-dependent RNA helicase dbp8 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3H7]  31.35 
 
 
525 aa  168  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  30.86 
 
 
755 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  30.86 
 
 
710 aa  167  9e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.37 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60418  ATP-dependent RNA helicase DBP7 (DEAD-box protein 7)  27.33 
 
 
733 aa  164  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.174628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  31.77 
 
 
656 aa  163  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  31.25 
 
 
528 aa  162  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  28.91 
 
 
474 aa  161  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40593  Dead-Box Protein 8, ATP-dependent helicase involved in rRNA processing  30.09 
 
 
445 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  29.61 
 
 
561 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.53 
 
 
467 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.65 
 
 
557 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.65 
 
 
557 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.65 
 
 
557 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.19 
 
 
525 aa  157  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.19 
 
 
528 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  31.19 
 
 
528 aa  157  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  31.19 
 
 
525 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.19 
 
 
528 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  31.19 
 
 
528 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  31.19 
 
 
533 aa  157  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  31.19 
 
 
528 aa  157  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0598  ATP-dependent RNA helicase DbpA  28.47 
 
 
468 aa  156  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.255467 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  29.46 
 
 
495 aa  157  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.73 
 
 
515 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24935  helicase_1  31.83 
 
 
455 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 
525 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 
525 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 
526 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.2 
 
 
527 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  32.24 
 
 
513 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0542  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.46 
 
 
411 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.337517  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 
538 aa  156  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  30.94 
 
 
529 aa  156  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.38 
 
 
477 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.13 
 
 
599 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 
567 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.39 
 
 
550 aa  155  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3971  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.94 
 
 
444 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160795  normal  0.568065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.87 
 
 
531 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 
498 aa  154  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.85 
 
 
583 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 
527 aa  154  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.62 
 
 
731 aa  153  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001525  cold-shock DEAD-box protein A  29.58 
 
 
644 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000079582  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2099  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.06 
 
 
427 aa  152  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.98 
 
 
559 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.22 
 
 
564 aa  153  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0299  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.23 
 
 
364 aa  153  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265949  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00204  ATP-dependent RNA helicase dbp7 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGX6]  27.22 
 
 
778 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0013  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.73 
 
 
463 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12565 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07420  hypothetical protein  33.02 
 
 
859 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.592915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
533 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.75 
 
 
577 aa  152  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.41 
 
 
492 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.65 
 
 
505 aa  152  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.91 
 
 
561 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  30.37 
 
 
484 aa  152  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.24 
 
 
565 aa  152  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.75 
 
 
578 aa  152  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.69 
 
 
496 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.88 
 
 
590 aa  151  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.5 
 
 
590 aa  151  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.24 
 
 
578 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 
511 aa  151  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 
514 aa  151  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0654  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.31 
 
 
439 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000031459  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  29.28 
 
 
799 aa  150  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
511 aa  150  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4664  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  30.2 
 
 
442 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.19 
 
 
594 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0214  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.6 
 
 
465 aa  150  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.64 
 
 
581 aa  150  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.36 
 
 
494 aa  150  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4766  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.85 
 
 
443 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1944  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.99 
 
 
465 aa  150  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.423586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1820  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.96 
 
 
447 aa  150  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>