More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02790 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
368 aa  755    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  71.27 
 
 
378 aa  509  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  65.85 
 
 
367 aa  487  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  56.25 
 
 
373 aa  408  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  54.92 
 
 
374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  54.38 
 
 
410 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  53.7 
 
 
367 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  50.4 
 
 
367 aa  375  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  52.7 
 
 
368 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  49.21 
 
 
407 aa  340  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  47.4 
 
 
369 aa  334  2e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  44.32 
 
 
364 aa  324  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  45.23 
 
 
367 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  45.01 
 
 
370 aa  318  9e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  43.32 
 
 
363 aa  315  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  45.01 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  43.94 
 
 
369 aa  296  5e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  42.47 
 
 
371 aa  295  7e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.75 
 
 
370 aa  294  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  43.94 
 
 
369 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  41.85 
 
 
371 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  43.54 
 
 
370 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  44.2 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  43.72 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  39.55 
 
 
370 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  39.39 
 
 
369 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  40.61 
 
 
368 aa  239  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  37.96 
 
 
346 aa  233  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  38.29 
 
 
370 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  42.86 
 
 
371 aa  219  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  27.49 
 
 
389 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  25.2 
 
 
389 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  28.49 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  29.3 
 
 
380 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  24.47 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  27.61 
 
 
328 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  27.37 
 
 
351 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  27.08 
 
 
357 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  25.34 
 
 
328 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  25.62 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  26.05 
 
 
311 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.07 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  36.36 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.46 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  39.64 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  31.97 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.48 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  36 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.73 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  35.65 
 
 
529 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  36 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  29.05 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.13 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.05 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  33.78 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  29.47 
 
 
450 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  36 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  35.2 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.25 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  28.31 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  34.92 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  36 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  32.43 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.03 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  33.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  40.94 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  32.43 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  33.78 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.48 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.8 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  33.54 
 
 
541 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  35 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.8 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  34.62 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  33.88 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  41.09 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  33.88 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  30.6 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  28.27 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  33.51 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  32.26 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  32.26 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  33.88 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.6 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  35.66 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.24 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  37.9 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  34.68 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.82 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.97 
 
 
505 aa  72.8  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  33.87 
 
 
434 aa  72.8  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  32 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>