49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1302 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  98.65 
 
 
223 aa  441  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  98.65 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  65.89 
 
 
221 aa  267  7e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  56.11 
 
 
227 aa  236  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  53.12 
 
 
227 aa  226  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  51.12 
 
 
230 aa  221  7e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  51.58 
 
 
221 aa  217  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  49.32 
 
 
232 aa  211  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  47.25 
 
 
216 aa  182  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  29.84 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  27.65 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  29.03 
 
 
292 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  31.61 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  30.05 
 
 
284 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  32.43 
 
 
281 aa  58.2  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  29.9 
 
 
273 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  32.22 
 
 
500 aa  55.8  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  29.44 
 
 
291 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  32.78 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  29.63 
 
 
285 aa  55.1  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  32.56 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  30.81 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  25.12 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  24.32 
 
 
294 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  27.92 
 
 
275 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  30.39 
 
 
278 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  28.49 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  25.2 
 
 
246 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  21.98 
 
 
625 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  22.78 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  25.12 
 
 
304 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  21.89 
 
 
626 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  25.33 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  26.98 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  27.51 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  27.27 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  30.9 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 
626 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  28.57 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  20.6 
 
 
271 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  30.34 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  47  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  21.52 
 
 
626 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  19.93 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  27.46 
 
 
274 aa  45.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  27.78 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  28.34 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>