More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0943 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  100 
 
 
282 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  99.29 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  95.41 
 
 
283 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  67.38 
 
 
282 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  60.81 
 
 
286 aa  347  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1037  signal peptidase I  62.63 
 
 
278 aa  344  1e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0844  signal peptidase I  58.39 
 
 
276 aa  329  3e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1173  signal peptidase I  57.39 
 
 
285 aa  317  2e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.478468  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  52.84 
 
 
301 aa  300  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1114  peptidase S26A, signal peptidase I  45.72 
 
 
269 aa  235  7e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.747736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.85 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  35.14 
 
 
262 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.05 
 
 
305 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  31.23 
 
 
276 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.53 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.29 
 
 
305 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.29 
 
 
305 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  34.09 
 
 
263 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  34.09 
 
 
263 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.29 
 
 
305 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  31.43 
 
 
276 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  36.03 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  35.14 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.29 
 
 
305 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.29 
 
 
305 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.29 
 
 
305 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.29 
 
 
305 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  30.85 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  35.71 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  33.33 
 
 
251 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  30.1 
 
 
268 aa  125  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  33.33 
 
 
251 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.4 
 
 
219 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  34.12 
 
 
305 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  35.56 
 
 
324 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  35.56 
 
 
324 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  35.56 
 
 
324 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  35.56 
 
 
324 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  35.56 
 
 
324 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  34.07 
 
 
324 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  34.07 
 
 
324 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  34.07 
 
 
324 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  34.07 
 
 
324 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  34.07 
 
 
324 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  34.83 
 
 
321 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  33.7 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  33.7 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  30.5 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  33.7 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  30.18 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  34.46 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  34.84 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.98 
 
 
198 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  29.96 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  32.96 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  30.34 
 
 
289 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  33.07 
 
 
225 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  33.2 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  34.73 
 
 
267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.41 
 
 
199 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  33.46 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.61 
 
 
263 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  31.94 
 
 
216 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  34.44 
 
 
324 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.38 
 
 
266 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  32.94 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  38.27 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  33.86 
 
 
304 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  35.16 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  34.63 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  34.55 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  36.18 
 
 
248 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  36.18 
 
 
248 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  33.86 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  35.16 
 
 
284 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  35.16 
 
 
284 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  31.65 
 
 
325 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  32.79 
 
 
342 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  31.54 
 
 
301 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.78 
 
 
267 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  33.86 
 
 
240 aa  115  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  32.72 
 
 
304 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  35.16 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  32.56 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.81 
 
 
220 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.2 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  34.85 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.6 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  33.59 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  33.46 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  32.81 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.6 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  36.22 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  31.17 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.6 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  29.84 
 
 
214 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  33.46 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  33.6 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>