More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0769 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0769  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  276  5e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0694  hypothetical protein  97.78 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1331  hypothetical protein  95.56 
 
 
135 aa  266  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0752  conserved hypothetical protein (UPF0079 domain protein)  60 
 
 
135 aa  165  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1981  hypothetical protein  58.78 
 
 
134 aa  152  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1238  hypothetical protein  58.46 
 
 
132 aa  148  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0851  hypothetical protein  54.89 
 
 
133 aa  147  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00201789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1067  hypothetical protein  56.82 
 
 
136 aa  147  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1024  protein of unknown function UPF0079  45.54 
 
 
143 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1150  hypothetical protein  40.88 
 
 
137 aa  103  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.864213  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  45 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  31.06 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  36.14 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  34.78 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.46 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  35.63 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  41.54 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  33.04 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  29.37 
 
 
169 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  32.48 
 
 
173 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  38.75 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  30.7 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  34.23 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  33.62 
 
 
164 aa  62  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  32.52 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  35.23 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  45.12 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  34.83 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  31.87 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  31.87 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  36.84 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.38 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.96 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  37.04 
 
 
184 aa  60.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  33.61 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  33.94 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  33.94 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.96 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  29.13 
 
 
184 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  35.96 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  33 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  33 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  35.04 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  32.76 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.96 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  31.75 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  31.36 
 
 
192 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  32.76 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  34.38 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  33.01 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  29.27 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  34.78 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  30.08 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  38.55 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  33.03 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  42.35 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  34.07 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  34.69 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2026  hypothetical protein  32.41 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  36.51 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  27.68 
 
 
184 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0525  hypothetical protein  36.26 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  29.91 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  37.35 
 
 
192 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  34.09 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  33.05 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.51 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  38.96 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  32.28 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  39.68 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  32.46 
 
 
192 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3215  protein of unknown function UPF0079  37.35 
 
 
194 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  35.44 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  34.38 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  34.38 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  30.28 
 
 
156 aa  57  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  38.82 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  34.86 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  31.19 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  35.8 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  37.66 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  34.07 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  32.61 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  34.52 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  34.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  34.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  34.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.66 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>