198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3062 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3062  formiminoglutamase-related protein  100 
 
 
409 aa  853    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.511055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0263  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40.2 
 
 
393 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1852  hypothetical protein  37.29 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00720  hypothetical protein  34.7 
 
 
388 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0708  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.59 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1744  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.52 
 
 
372 aa  189  9e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.311392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.9 
 
 
316 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.56 
 
 
328 aa  77  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  24.91 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  26.13 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.55 
 
 
316 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  22.14 
 
 
312 aa  60.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  22.58 
 
 
311 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  22.58 
 
 
311 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  25.36 
 
 
318 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  24.4 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  23.33 
 
 
313 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  25 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  25.36 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  25 
 
 
354 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  25 
 
 
354 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  23.96 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  25 
 
 
318 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  23.33 
 
 
313 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  25.18 
 
 
318 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  24.55 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  26.13 
 
 
308 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  22.96 
 
 
313 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  24.56 
 
 
324 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  22.73 
 
 
318 aa  57  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  22.96 
 
 
313 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  22.76 
 
 
334 aa  56.2  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  23.7 
 
 
313 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  24.07 
 
 
478 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  23.64 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  24.47 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  22.61 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  23.73 
 
 
323 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  21.94 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  23.58 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.51 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  22.09 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  22.09 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  22.09 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  22.26 
 
 
322 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  22.7 
 
 
316 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  24.92 
 
 
324 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  25 
 
 
322 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  23.1 
 
 
310 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  22.33 
 
 
287 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  24.26 
 
 
318 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  25.6 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  24.26 
 
 
318 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  25 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  21.33 
 
 
346 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  23.13 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  22.58 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  24.77 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  22.34 
 
 
351 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  23.51 
 
 
319 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  22.58 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  22.66 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  23.66 
 
 
325 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  25.42 
 
 
324 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  22.76 
 
 
320 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  22.66 
 
 
316 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  25.35 
 
 
315 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  23.51 
 
 
319 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  25.76 
 
 
321 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  24.83 
 
 
307 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  24.43 
 
 
299 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  21.45 
 
 
321 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  21.05 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  23.76 
 
 
342 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  22.74 
 
 
316 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  24.05 
 
 
323 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  22.59 
 
 
396 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  26.28 
 
 
348 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  25.52 
 
 
322 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  22.51 
 
 
311 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  22.73 
 
 
323 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  22.94 
 
 
325 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  24.66 
 
 
283 aa  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  22.96 
 
 
304 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  24.77 
 
 
328 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  22.94 
 
 
323 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  22.94 
 
 
322 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  23.76 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  23 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  26.71 
 
 
305 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  21.58 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  26.76 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  24.83 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  24.2 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  23.13 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  23.38 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  23.36 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  21.97 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  21.97 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  24.2 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>