31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2444 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  42.77 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  41.04 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  37.24 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  38.52 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  44.04 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  42.57 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  33.11 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  42.31 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  43 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  47.25 
 
 		 270 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  39.39 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  33.56 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  38.38 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  38.54 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  33.67 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  34.04 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  31.96 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  29.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  37.35 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  41.98 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  34.52 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  32.32 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  33.33 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  35.63 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  32.1 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  32.5 
 
 		 285 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  31.75 
 
 		 347 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  30.39 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  26.04 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>