More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1310 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  78.75 
 
 		 161 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  73.58 
 
 		 162 aa  251  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  71.88 
 
 		 161 aa  250  7e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  62.73 
 
 		 161 aa  226  7e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  63.98 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  63.35 
 
 		 161 aa  224  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  63.35 
 
 		 161 aa  224  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 171 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 157 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  157  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 203 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 168 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  48.73 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  50.66 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  51.63 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  47.77 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  48.75 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 176 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  47.13 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>