141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0377 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0377  Holliday junction resolvase-like protein  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1578  Holliday junction resolvase-like protein  59.17 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0873  Holliday junction resolvase YqgF  61.79 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0928843  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0945  Holliday junction resolvase-like protein  58.06 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.854613  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1124  Holliday junction resolvase-like protein  57.85 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0662125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1364  Holliday junction resolvase-like protein  58.68 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.451878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0738  Holliday junction resolvase-like protein  58.2 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.53595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0663  Holliday junction resolvase-like protein  57.38 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.907248  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0527  Holliday junction resolvase-like protein  54.1 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0094  Holliday junction resolvase YqgF  31.82 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0018567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2739  Holliday junction resolvase YqgF  36.92 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0738  Holliday junction resolvase-like protein  33.59 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0755  Holliday junction resolvase-like protein  33.59 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.302865  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2326  Holliday junction resolvase-like protein  33.87 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0474  Holliday junction resolvase YqgF  35.38 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00800439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1996  Holliday junction resolvase-like protein  36 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3169  Holliday junction resolvase-like protein  36 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0917  Holliday junction resolvase-like protein  36 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2747  Holliday junction resolvase-like protein  36 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3147  Holliday junction resolvase-like protein  36 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1858  Holliday junction resolvase-like protein  36 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2523  Holliday junction resolvase-like protein  34.38 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159244 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3111  Holliday junction resolvase-like protein  36 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  32.06 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  30.77 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0383  Holliday junction resolvase-like protein  34.38 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0865  Holliday junction resolvase-like protein  34.38 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0836  Holliday junction resolvase-like protein  34.38 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  hitchhiker  0.00221177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3963  Holliday junction resolvase-like protein  34.38 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1828  Holliday junction resolvase YqgF  28.35 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3810  Holliday junction resolvase-like protein  34.4 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1790  Holliday junction resolvase YqgF  28.57 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00751815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0873  Holliday junction resolvase YqgF  31.06 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0869  Holliday junction resolvase-like protein  34.4 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2024  Holliday junction resolvase YqgF  29.69 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3713  Holliday junction resolvase YqgF  29.23 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0658941  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1463  Holliday junction resolvase-like protein  34.4 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0460  hypothetical protein  28.91 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0417  Holliday junction resolvase YqgF  33.82 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2479  Holliday junction resolvase-like protein  30.23 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2535  Holliday junction resolvase-like protein  34.38 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52249 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0205  Holliday junction resolvase YqgF  27.87 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0938  Holliday junction resolvase YqgF  31.82 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05800  Holliday junction resolvase YqgF  32.09 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.209228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3225  Holliday junction resolvase YqgF  28.57 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0565  hypothetical protein  29.46 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.690098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0088  Holliday junction resolvase YqgF  32.58 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2800  Holliday junction resolvase YqgF  31.3 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2727  Holliday junction resolvase-like protein  31.78 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2633  Holliday junction resolvase-like protein  31.78 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3099  Holliday junction resolvase-like protein  31.82 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00212776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1491  Holliday junction resolvase-like protein  31.3 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000748947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0915  Holliday junction resolvase YqgF  29.23 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.242003  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1191  Holliday junction resolvase YqgF  30.23 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000237997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3804  Holliday junction resolvase-like protein  32.33 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3061  hypothetical protein  32.31 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3633  Holliday junction resolvase YqgF  30.77 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2668  Holliday junction resolvase YqgF  32.31 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.933138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1427  Holliday junction resolvase-like protein  30.34 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1360  Holliday junction resolvase-like protein  30.34 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1640  Holliday junction resolvase YqgF  30 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.278901  normal  0.163549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1232  Holliday junction resolvase-like protein  31.78 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4233  Holliday junction resolvase-like protein  31.06 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000272031  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0952  Holliday junction resolvase YqgF  30.16 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.403393  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1032  Holliday junction resolvase YqgF  29.32 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2047  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0906  Holliday junction resolvase-like protein  30.65 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0925  Holliday junction resolvase YqgF  31.2 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1329  Holliday junction resolvase YqgF  25.74 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0531797  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1969  Holliday junction resolvase-like protein  31.88 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0212683 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08551  endonuclease  30.3 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1942  Holliday junction resolvase-like protein  31.88 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1211  Holliday junction resolvase YqgF  27.56 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.271637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1130  Holliday junction resolvase YqgF  30.3 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0314  Holliday junction resolvase YqgF  26.56 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3098  Holliday junction resolvase-like protein  29.55 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2031  Holliday junction resolvase-like protein  29.1 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1748  Holliday junction resolvase-like protein  29.1 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4379  Holliday junction resolvase-like protein  31.16 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.556882  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08521  endonuclease  30.3 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.329669  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0456  Holliday junction resolvase-like protein  29.01 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0531997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2514  Holliday junction resolvase-like protein  31.85 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.36708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2742  Holliday junction resolvase-like protein  32.81 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2570  Holliday junction resolvase YqgF  30.23 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00347975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1438  Holliday junction resolvase YqgF  29.69 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0102  Holliday junction resolvase YqgF  32.35 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0153  Holliday junction resolvase-like protein  31.06 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0185653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4469  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000240455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4282  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000036093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4119  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.61572e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4130  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000238321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4614  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000846091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4466  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4519  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000203205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2805  Holliday junction resolvase YqgF  28.68 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0601  Holliday junction resolvase YqgF  30.23 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2352  Holliday junction resolvase YqgF  29.46 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2265  Holliday junction resolvase YqgF  31.3 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4506  Holliday junction resolvase-like protein  29.55 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4344  Holliday junction resolvase YqgF  30.53 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.892789  normal  0.367855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>