43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1696 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  100 
 
 
764 aa  1548    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  58.64 
 
 
753 aa  906    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  76.69 
 
 
762 aa  1218    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  49.34 
 
 
734 aa  685    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  41.17 
 
 
802 aa  612  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  40.13 
 
 
800 aa  585  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  36.4 
 
 
847 aa  543  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  37.33 
 
 
847 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  38.96 
 
 
859 aa  524  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  35.33 
 
 
859 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  32.84 
 
 
653 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  32.84 
 
 
658 aa  214  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  28.38 
 
 
1050 aa  117  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  28.65 
 
 
1071 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  26.42 
 
 
1031 aa  101  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  25.27 
 
 
1100 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  24.72 
 
 
1043 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  26 
 
 
1104 aa  89  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  23.13 
 
 
1076 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  27.05 
 
 
1144 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  23.31 
 
 
1046 aa  85.5  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  28.68 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  23.66 
 
 
1106 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.51 
 
 
505 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.73 
 
 
679 aa  54.3  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  25.87 
 
 
571 aa  50.8  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.55 
 
 
709 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  21.83 
 
 
524 aa  48.5  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  34.52 
 
 
934 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.67 
 
 
511 aa  47.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  24.31 
 
 
516 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  25.66 
 
 
497 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  25.66 
 
 
497 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  25.66 
 
 
497 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  48.21 
 
 
615 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.85 
 
 
523 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.06 
 
 
564 aa  45.8  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.95 
 
 
593 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.89 
 
 
493 aa  45.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  24.49 
 
 
623 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  29.07 
 
 
526 aa  44.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2022  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.3 
 
 
557 aa  44.3  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.53 
 
 
523 aa  44.3  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>