64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0050 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  47.33 
 
 
284 aa  248  8e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  41.2 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.92 
 
 
289 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.32 
 
 
280 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.85 
 
 
280 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.36 
 
 
290 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  46.59 
 
 
281 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.31 
 
 
296 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.28 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  33.71 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.34 
 
 
306 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.11 
 
 
283 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.97 
 
 
306 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.96 
 
 
289 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  29.6 
 
 
319 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  29.6 
 
 
319 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  29.96 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.43 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.88 
 
 
332 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.11 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.29 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.81 
 
 
279 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.16 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.47 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.49 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.56 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  22.92 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  26.67 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  25.2 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  27.73 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  25.79 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  22.28 
 
 
253 aa  55.8  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  25.35 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  24.53 
 
 
313 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  26.67 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2236  DNA adenine methylase  22.13 
 
 
314 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00406547  hitchhiker  0.0000680943 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  29.49 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  21.85 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.9 
 
 
306 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  26.73 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  24.31 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  25.37 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  28.78 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  27.01 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  25.5 
 
 
263 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.02 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  24.26 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.35 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0202  DNA adenine methylase  22.57 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  26.29 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.4 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  21.89 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  27.03 
 
 
259 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  25.1 
 
 
638 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  21.96 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  22.64 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  24.3 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.27 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.22 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  22.59 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  24.51 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  22.69 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  23.46 
 
 
288 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>