115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1237 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 81 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  88.89 
 
 		 81 aa  144  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  72.84 
 
 		 81 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  71.6 
 
 		 81 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  71.6 
 
 		 81 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  71.6 
 
 		 81 aa  120  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  69.14 
 
 		 81 aa  120  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  71.79 
 
 		 82 aa  114  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  60.49 
 
 		 82 aa  107  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1026  RNA-binding S4 domain protein  70 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.319411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  46.88 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.97 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  41.77 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.57 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.88 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  39.47 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  44.44 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.99 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  37.18 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  47.62 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  39.51 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  46.03 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  39.51 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  49.02 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  42.62 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  47.06 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  36.92 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.02 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  37.5 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  45.1 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  46.03 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.06 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.06 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.06 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  47.06 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  45.1 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  47.06 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  39.44 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  45.1 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  36.62 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  33.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.06 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  35.62 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  30.77 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  36.51 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.71 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  32.91 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  37.25 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  32.91 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  40.82 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  30.38 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  36.51 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  32.47 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.77 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3883  RNA-binding S4 domain protein  32.91 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  32.47 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  34.57 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  31.34 
 
 		 128 aa  43.9  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.38 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  38.78 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  41.3 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  31.15 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  38 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.65 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  38 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  38.78 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.65 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  38 
 
 		 138 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  36 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  29.11 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.11 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  34 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  36 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  34 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  27.27 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  31.15 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  34 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  34 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3749  RNA-binding S4 domain protein  32.2 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>