More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13478 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  59.19 
 
 
293 aa  354  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.25 
 
 
278 aa  332  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.48 
 
 
278 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  45.85 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.25 
 
 
311 aa  228  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.24 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.09 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.69 
 
 
285 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  32.82 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.1 
 
 
293 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.87 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.25 
 
 
288 aa  123  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.18 
 
 
290 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.65 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.03 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.52 
 
 
289 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.17 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.68 
 
 
316 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.56 
 
 
316 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  33.64 
 
 
258 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 
299 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.28 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.7 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.61 
 
 
300 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.61 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.05 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.05 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.27 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  29.25 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.75 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.52 
 
 
303 aa  95.9  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.89 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.52 
 
 
296 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  31.19 
 
 
284 aa  95.5  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.89 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.24 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.89 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.12 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.89 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.64 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  25.73 
 
 
318 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  26.37 
 
 
275 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.73 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.73 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.73 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.73 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.63 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.93 
 
 
319 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.37 
 
 
308 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.76 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  29.17 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.28 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.86 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.29 
 
 
297 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.54 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.28 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  26.54 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  26.54 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.63 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.11 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.19 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  28.83 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.91 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.11 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
506 aa  89.7  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.57 
 
 
307 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  30.33 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.79 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.67 
 
 
298 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.65 
 
 
315 aa  89  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.04 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.5 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.81 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.49 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  26.71 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.35 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  27.43 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.67 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.45 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.45 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.19 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.37 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.51 
 
 
296 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 
312 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.43 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.65 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.72 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.73 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2360  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.998553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.73 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>