32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12918 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  317  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  42.77 
 
 
161 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  47.5 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  39.04 
 
 
155 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  44.36 
 
 
147 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  47.66 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  42.42 
 
 
153 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  47.13 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  41.84 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  42.11 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  46.53 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  42.45 
 
 
131 aa  84.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  35.85 
 
 
362 aa  74.7  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  37.4 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  35.16 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  33.33 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  38.3 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  37.08 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  38.94 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  36.45 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  34.83 
 
 
229 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  36.67 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  29.7 
 
 
388 aa  58.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  35.16 
 
 
231 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  34.88 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  36.79 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  32.56 
 
 
231 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  30.43 
 
 
347 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0508  hypothetical protein  47.92 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  26.25 
 
 
268 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>