More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02065 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02065  putative transmembrane protein  100 
 
 
193 aa  368  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.98 
 
 
192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.21 
 
 
193 aa  229  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.61 
 
 
189 aa  221  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.69 
 
 
191 aa  210  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.08 
 
 
189 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1119  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.92 
 
 
188 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.628866 
 
 
-
 
NC_002950  PG0224  hypothetical protein  47.06 
 
 
212 aa  177  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1097  hypothetical protein  46.96 
 
 
197 aa  169  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.177392 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  33.66 
 
 
209 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  33.17 
 
 
209 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.26 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.43 
 
 
215 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.14 
 
 
204 aa  94  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  32 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.16 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.38 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.79 
 
 
197 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  31.79 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.79 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.79 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.79 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.79 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.79 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.79 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.57 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.87 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.23 
 
 
213 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  28.65 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  30.93 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.7 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.93 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.21 
 
 
209 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.71 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  26.67 
 
 
214 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.41 
 
 
205 aa  89  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.23 
 
 
197 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  26.67 
 
 
214 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.49 
 
 
206 aa  88.2  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  29.02 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  27.98 
 
 
214 aa  87.8  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.41 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.85 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  26.67 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  28.79 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.71 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.58 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.08 
 
 
197 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  34.74 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  29.8 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  30.3 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.79 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.21 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  27.98 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  32.31 
 
 
216 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  30.43 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.5 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.31 
 
 
218 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.64 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  30.5 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.06 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.53 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  31.53 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  31.31 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.05 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.65 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  31.09 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.52 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.4 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.39 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.02 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.2 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0561  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.78 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.143657 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.89 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.02 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.02 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.02 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.03 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.29 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.22 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.51 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.47 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  29.17 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.84 
 
 
213 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  32.47 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  28.27 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.14 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.53 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>