More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2433 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 191 aa  360  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.38 
 
 		 189 aa  256  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.53 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1119  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.96 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.07 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.01 
 
 		 193 aa  205  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1097  hypothetical protein  48.63 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.177392 
 
 
-
 
NC_002950  PG0224  hypothetical protein  46.03 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02065  putative transmembrane protein  52.69 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808084  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.8 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  31.52 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  28.71 
 
 		 214 aa  85.1  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.76 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.59 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.59 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.59 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.59 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.59 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.02 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  31.02 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.02 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.02 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  31.02 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.02 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.02 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.02 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.02 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.61 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.09 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  30.69 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.69 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  32.61 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.89 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0561  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.17 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.143657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.06 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.65 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.23 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.65 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  28.06 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  28.06 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.37 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  28.93 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.37 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.41 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  28.96 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.69 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.72 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.65 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.09 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.73 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.79 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.67 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  28.49 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.79 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  30 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  30 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  30.1 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  29.26 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.13 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  29.59 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  27.42 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  29.57 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0442  hypothetical protein  34.39 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.67 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.73 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.63 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.47 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  27.05 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  26.32 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.32 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.28 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10401  hypothetical protein  29.26 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.67 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.67 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  29.7 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  26.23 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.79 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.57 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  29.08 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1532  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.72 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000919754  unclonable  2.03359e-19 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  27.42 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  27.42 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  27.04 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  27.42 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.92 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.07 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  27.42 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>