More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0442 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0442  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  321  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0561  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.01 
 
 
207 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.143657 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.13 
 
 
212 aa  90.9  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.92 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.73 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  32.89 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
217 aa  79  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.34 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.96 
 
 
192 aa  77.4  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.29 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.03 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  33.93 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.12 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1097  hypothetical protein  35.37 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.177392 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.73 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.54 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.73 
 
 
201 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  27.65 
 
 
212 aa  74.3  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.35 
 
 
200 aa  73.9  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.39 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.48 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1119  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.69 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.628866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  28.86 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  33.12 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  29.7 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.65 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.3 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.95 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.69 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  28.82 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.38 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.82 
 
 
248 aa  70.9  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.87 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.38 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.52 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  27.74 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  27.92 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  31.03 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  31.03 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  31.03 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  31.03 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.5 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.88 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  31.03 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0224  hypothetical protein  30.57 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  27.1 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  30.95 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 
216 aa  67.8  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  31.14 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.45 
 
 
242 aa  67.4  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  32.89 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  31.68 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  28.66 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.88 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.54 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.55 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.9 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.54 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0042  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.43 
 
 
212 aa  67  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.65 
 
 
211 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  27.92 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  26.71 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.38 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.38 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.65 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.93 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.14 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.49 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  27.7 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02065  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808084  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  27.7 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.47 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.57 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.92 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  30.41 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.42 
 
 
197 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.34 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  27.1 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  30.41 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  29.45 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.95 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  29.45 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  29.45 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  29.45 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  28.92 
 
 
216 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  29.45 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>