61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00590 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  53.37 
 
 
176 aa  190  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  54.32 
 
 
178 aa  167  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  35.68 
 
 
192 aa  104  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  29.57 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  33.88 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  32.78 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  27.72 
 
 
189 aa  89  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  32.6 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  28.18 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  30.53 
 
 
196 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  32.22 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  31.49 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  31.49 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  31.49 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  31.49 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  30.39 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  30.39 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  30.39 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  31.49 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  28.98 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  24.86 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  26.95 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  29.12 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  25.79 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  24.86 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  27.32 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  26.34 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  28.82 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  28.49 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  29.53 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  27.37 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  30.81 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  26.97 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  25.97 
 
 
189 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  28.49 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  24.46 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  25.75 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  24.18 
 
 
191 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25.84 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  28.39 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  25.61 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  31.36 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  23.33 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  27.78 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  27.78 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  25.58 
 
 
187 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  26.78 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  25 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  26.63 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  26.37 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  24.71 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  27.35 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  23.03 
 
 
183 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  21.97 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  21.39 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4738  hypothetical protein  25.29 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  28.33 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  26.22 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  24.55 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>