56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1080 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1080  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2149  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 380 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02925  putative glycosyltransferase  22.04 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  26.74 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  25.43 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 904 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1122  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 380 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.38 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  33.63 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.93 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.53 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 770 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  25.52 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  38.16 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  23.46 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.77 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  39.51 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.52 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>