More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0485 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0485  putative transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
332 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0324291  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  73.52 
 
 
339 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3762  putative transposase  64.18 
 
 
341 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.915156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2240  transposase, IS1111 family  59.39 
 
 
339 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000963569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3882  transposase, IS1111 family  59.39 
 
 
339 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6580  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.53 
 
 
341 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0128065  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  53.73 
 
 
341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.45 
 
 
336 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.49 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  54.49 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.49 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  54.49 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.49 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.68 
 
 
346 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1747  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.68 
 
 
346 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279205  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1396  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.68 
 
 
346 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.199671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4127  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  66.12 
 
 
253 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177688  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.08 
 
 
344 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.85 
 
 
343 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.85 
 
 
343 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.26 
 
 
347 aa  292  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.38 
 
 
499 aa  292  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45 
 
 
346 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  41.59 
 
 
341 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  41.28 
 
 
341 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  43.25 
 
 
343 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 
338 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 
338 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 
338 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 
338 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 
338 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 
338 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  41.77 
 
 
338 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  41.77 
 
 
338 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  41.77 
 
 
338 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  41.77 
 
 
338 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
341 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
341 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.67 
 
 
338 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.67 
 
 
338 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.67 
 
 
338 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.67 
 
 
338 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.67 
 
 
338 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.67 
 
 
338 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.67 
 
 
338 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.67 
 
 
338 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  42.25 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.08 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.08 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7434  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.24 
 
 
275 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 
340 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  40.36 
 
 
338 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  40.5 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  42.2 
 
 
342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  40.5 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  42.2 
 
 
342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  40.5 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  40.5 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.06 
 
 
338 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.65 
 
 
338 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.36 
 
 
338 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.36 
 
 
338 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.36 
 
 
338 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.12 
 
 
338 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.06 
 
 
338 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  40.48 
 
 
343 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.72 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  43.84 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  43.34 
 
 
341 aa  232  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  42.64 
 
 
342 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  41.85 
 
 
349 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.49 
 
 
338 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  42.94 
 
 
342 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.94 
 
 
348 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.87 
 
 
346 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.76 
 
 
356 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  40.44 
 
 
322 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  41.47 
 
 
340 aa  225  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  38.34 
 
 
338 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.69 
 
 
348 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02906  probable transposase  39.82 
 
 
347 aa  222  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142425  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  39.69 
 
 
348 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  40.76 
 
 
338 aa  221  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  39.94 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  39.82 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  39.82 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  39.82 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  39.82 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  39.82 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.41 
 
 
340 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  39.23 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.23 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.23 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.23 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.23 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.23 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.39 
 
 
311 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>