More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0043 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2787  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.48 
 
 
670 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2779  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.14 
 
 
504 aa  724    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.470369 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.48 
 
 
670 aa  658    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0130  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.48 
 
 
670 aa  658    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1048  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.48 
 
 
664 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0426  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.27 
 
 
556 aa  663    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1122  ATP synthase F1, alpha subunit  68.86 
 
 
525 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0154  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.48 
 
 
670 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2645  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.48 
 
 
666 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.727067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1885  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.84 
 
 
510 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879266  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0043  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
530 aa  1041    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5553  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.74 
 
 
522 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175535  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19740  ATP synthase F1, alpha subunit  67.79 
 
 
513 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1050  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.06 
 
 
517 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3935  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  65.25 
 
 
497 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455536  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4103  ATP synthase F1, alpha subunit  60.74 
 
 
497 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0134913  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  49.27 
 
 
541 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.49 
 
 
505 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.59 
 
 
505 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.03 
 
 
502 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.67 
 
 
510 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.84 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.84 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.95 
 
 
528 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.03 
 
 
502 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.44 
 
 
517 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.39 
 
 
502 aa  465  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  50.1 
 
 
508 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.9 
 
 
504 aa  462  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.66 
 
 
507 aa  460  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  47.49 
 
 
512 aa  459  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.96 
 
 
508 aa  460  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.44 
 
 
526 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.88 
 
 
503 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  49.12 
 
 
504 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  49.56 
 
 
508 aa  455  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.2 
 
 
520 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.43 
 
 
571 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.67 
 
 
522 aa  458  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.79 
 
 
503 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.33 
 
 
511 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.33 
 
 
506 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
507 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  49.78 
 
 
503 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.79 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.13 
 
 
526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.88 
 
 
503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.94 
 
 
511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.87 
 
 
534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.6 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.29 
 
 
503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.93 
 
 
519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.78 
 
 
505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.35 
 
 
502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.6 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  48.71 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.68 
 
 
526 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.53 
 
 
503 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.06 
 
 
517 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0283869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.52 
 
 
502 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  55.4 
 
 
585 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.14 
 
 
504 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.06 
 
 
526 aa  451  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.47 
 
 
505 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.96 
 
 
503 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.96 
 
 
503 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.59 
 
 
505 aa  452  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  47.84 
 
 
507 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.93 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.13 
 
 
502 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.99 
 
 
502 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.46 
 
 
526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.61 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.93 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.83 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.71 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.71 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.22 
 
 
526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.93 
 
 
502 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.5 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  52.83 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  50.77 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.46 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.9 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.5 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  49.79 
 
 
526 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.22 
 
 
526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.31 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.01 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.01 
 
 
504 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2799  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.72 
 
 
513 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.55 
 
 
502 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.67 
 
 
522 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.746829 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0082  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.39 
 
 
525 aa  442  1e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.61 
 
 
509 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>