More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1017 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1017  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246391  normal  0.0984563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5702  protein tyrosine phosphatase  83.91 
 
 		 173 aa  297  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947024  normal  0.758266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3987  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000154412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 287 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.43 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 298 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  36.53 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  41.43 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.43 
 
 		 175 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 175 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 309 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.16 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  40.69 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  40.14 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.03 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 270 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  34.87 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 		 169 aa  97.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  38.73 
 
 		 295 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 276 aa  96.3  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 291 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 		 182 aa  95.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.76 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 175 aa  94.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  38.73 
 
 		 317 aa  94.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 178 aa  94.4  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  38.03 
 
 		 165 aa  94  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  40.54 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.08 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  36.88 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  36.67 
 
 		 164 aa  91.3  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.08 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.59 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  32.39 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.97 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.84 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.77 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 317 aa  87.8  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 		 177 aa  87.4  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  34.69 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.62 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.55 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  33.53 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  33.53 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  33.53 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  33.53 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  32.53 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  33.53 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  34.12 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  41.82 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  33.53 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  31.93 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  33.77 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  32.53 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  32.53 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  34.9 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  40.54 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.441606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>