79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3521 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  347  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  71.95 
 
 		 165 aa  257  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  71.95 
 
 		 165 aa  257  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  75.66 
 
 		 158 aa  248  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  50.33 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  51.06 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  55.07 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  47.48 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  50.36 
 
 		 146 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  46.76 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  49.63 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  43.26 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  41.48 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  39.86 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  34.33 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  33.88 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.87 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.77 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  34.35 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  37.6 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.15 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  34.68 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.37 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.82 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.14 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.86 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.86 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.86 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.86 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.86 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.86 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.88 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.7 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  25.9 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  24.03 
 
 		 131 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  26.47 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  20.59 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.69 
 
 		 941 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  25.74 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  24.41 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  28.68 
 
 		 736 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  27.2 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  22.9 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.15 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  23.08 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  22.48 
 
 		 138 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.23 
 
 		 689 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.73 
 
 		 779 aa  44.7  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  22.79 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  24 
 
 		 135 aa  44.3  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  23.31 
 
 		 133 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  21.8 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  25.62 
 
 		 277 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  25.38 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  23.48 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1446  hemerythrin-like metal-binding protein  30.86 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.7 
 
 		 722 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  22.14 
 
 		 667 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  25.38 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  23.48 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  23.85 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  18.12 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  24.06 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2505  response regulator receiver domain-containing protein  28.28 
 
 		 316 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  20 
 
 		 155 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  24.22 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  24.64 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  20.93 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  22.22 
 
 		 360 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  29.71 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  23.66 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>