182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1349 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  87.92 
 
 
240 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  38.37 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  37.66 
 
 
229 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  36.33 
 
 
242 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  37.55 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  36.73 
 
 
239 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  37.14 
 
 
223 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  38.11 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  37.7 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  37.3 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  37.7 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  35.68 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  36.84 
 
 
223 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  37.3 
 
 
223 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  35.51 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  35.83 
 
 
261 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  36.1 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  34.57 
 
 
237 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  33.06 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  41.41 
 
 
208 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  41.41 
 
 
208 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  38.85 
 
 
147 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  31.03 
 
 
252 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  31.82 
 
 
261 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  33.61 
 
 
259 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  30.86 
 
 
266 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  30.86 
 
 
266 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  29.78 
 
 
281 aa  98.6  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  33.06 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  32.93 
 
 
257 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  29.72 
 
 
259 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  30.58 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  29.44 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  28.88 
 
 
268 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  32.32 
 
 
254 aa  92  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  28.19 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29.58 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  27.21 
 
 
256 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  30.04 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  28.92 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  28.14 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  32.88 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.34 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  28.05 
 
 
227 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  28.99 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  28.7 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  29.55 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  29.03 
 
 
252 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.88 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  29.92 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  28.64 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  27.73 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  28 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  30.62 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  28.68 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  26.91 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  29.8 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  30.63 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.42 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  32.02 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  28.23 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  27.84 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.21 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  27.46 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  27.17 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  26.12 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  28.98 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  29.39 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  28.44 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  30.88 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  28.98 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  27.8 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  29.46 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  29.44 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  28.91 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  27.14 
 
 
221 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  25.5 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  27.63 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  30.9 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  28.77 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  27.57 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  24.63 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  29.38 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.05 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  33.55 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.44 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  28.05 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  24.41 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  27.31 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  25.98 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  27.01 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  27.39 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  29.25 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  30.95 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  25.83 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  24.2 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>