60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3852 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  51.7 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  50.19 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  50.74 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  50.58 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  30.96 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  38.51 
 
 		 192 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  33.51 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  33.51 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  33.51 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  33.51 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  33.51 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  33.51 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  33.51 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  32.63 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  31.31 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  29.53 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  29 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  24.9 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  30.81 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  28.48 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  27.64 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 185 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 181 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  31.18 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  32.26 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 197 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  29.47 
 
 		 459 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  31.37 
 
 		 180 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  28.46 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  48.84 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  34.48 
 
 		 145 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.2 
 
 		 184 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>