More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3331 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3331  amidase  100 
 
 		 428 aa  863    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1032  amidase  43.33 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.516301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  43.74 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3290  amidase  46.45 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3603  malonamidase E2  49.01 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3419  amidase  41.1 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1179  amidase  41.49 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1323  amidase  45.28 
 
 		 421 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7127  hypothetical protein  38.11 
 
 		 436 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6302  amidase  44.69 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1306  putative amidase  41.12 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.902626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0343  amidase  41.28 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0309  putative amidase (amiD)  38.62 
 
 		 448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.613123  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1832  amidase  40.39 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119712  normal  0.725364 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11219  amidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14410)  36.71 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.016892  normal  0.194738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5904  amidase  44.88 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424342  normal  0.115898 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3015  amidase  39.59 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3369  Asp-tRNA Asn/Glu-tRNA Gln amidotransferase subunit A  39.59 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  39.29 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4589  Amidase  41.78 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2263  amidase  39.11 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241532  normal  0.548827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4799  amidase  40.85 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0852  Amidase  41.61 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2779  Amidase  40.27 
 
 		 425 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0877  Amidase  40.19 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0916  amidase  40.43 
 
 		 413 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0163  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.72 
 
 		 499 aa  173  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.54 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.99 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.64 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  30.93 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.23 
 
 		 491 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.67 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  36.39 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.08 
 
 		 483 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.9 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.34 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  30.65 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.86 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  31.26 
 
 		 475 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0606  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.63 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.12 
 
 		 483 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8074  Amidase  33.19 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.51 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.29 
 
 		 487 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1839  Amidase  37.67 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  29.32 
 
 		 470 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.1 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  35.51 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  30.39 
 
 		 526 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29 
 
 		 475 aa  152  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  28.48 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.35 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  28.44 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.97 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.71 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.71 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.99 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.68 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  32.29 
 
 		 480 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.71 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.28 
 
 		 498 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0105  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.34 
 
 		 513 aa  149  8e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.693508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.01 
 
 		 475 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10590  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.36 
 
 		 503 aa  149  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.701412  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1112  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.72 
 
 		 491 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.881874  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  31.36 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.96 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.96 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0237  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.64 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.780008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  31.1 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.75 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.31 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0231  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.4 
 
 		 500 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.747986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.29 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  33.17 
 
 		 459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3274  Amidase  35.13 
 
 		 459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201611  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.51 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2827  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  31.83 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.97 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.47 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.78 
 
 		 489 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.52 
 
 		 516 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1206  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.02 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.58 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.13 
 
 		 464 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  34.95 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  28.48 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.29 
 
 		 486 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.38 
 
 		 496 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0373  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.62 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6034  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.5 
 
 		 506 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.18 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.08 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.17 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  30.64 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.33 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.67 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  31.8 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>