More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3113 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0797  acetyl-CoA acetyltransferases  86.54 
 
 		 416 aa  704    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0749989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0272  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  84.26 
 
 		 416 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3113  Acetyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 		 416 aa  840    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601433  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0040  acetyl-CoA acetyltransferase  66.83 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.632212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14260  beta-ketothiolase  61.86 
 
 		 416 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2050  acetyl-CoA acetyltransferase  58.84 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2403  acetyl-CoA acetyltransferase  59.08 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3355  beta-ketothiolase  61.01 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2940  thiolase family protein  55.5 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2725  thiolase  56.59 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378058  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2491  acetyl-CoA acetyltransferase  55.09 
 
 		 423 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0068  acetyl-CoA acetyltransferase  41.04 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0080  acetyl-CoA acetyltransferase  41.04 
 
 		 398 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 		 393 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  38.78 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0064  acetyl-CoA acetyltransferase  41.5 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  41.04 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  40.55 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0062  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 		 398 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  40.4 
 
 		 391 aa  262  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45947  predicted protein  39.9 
 
 		 403 aa  262  8.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  39.07 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  40.34 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  39.7 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  39.21 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  38.81 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  39.24 
 
 		 391 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  39.32 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  39.24 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  37.87 
 
 		 391 aa  253  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  38.89 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  40.94 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  38.52 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  37.47 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  38.06 
 
 		 411 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  39.61 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  39.11 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  39.31 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  41.04 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  38.27 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  40.3 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  35.34 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  36.88 
 
 		 392 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  37.72 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  37.72 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  37.62 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  36.86 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  39.85 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  39.51 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.02 
 
 		 409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  37.53 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  38.77 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  39.22 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  39.27 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.84 
 
 		 424 aa  242  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  38.21 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  34.62 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  37.78 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  37.68 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  39.46 
 
 		 395 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1778  acetyl-CoA acetyltransferase  38.39 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3545  acetyl-CoA acetyltransferase  37.38 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  38.63 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  37.75 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  36.86 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  38.48 
 
 		 392 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  38.08 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  37.59 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  37.72 
 
 		 396 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  36.79 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  37.59 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  38.24 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.77 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  37.59 
 
 		 393 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  37.47 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  37.47 
 
 		 427 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  40.2 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  38.63 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  38.39 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  37.47 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  37.47 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  38.39 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  36.95 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  37.22 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  39.01 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>