More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0332 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  100 
 
 		 421 aa  848    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  72.41 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  70.44 
 
 		 394 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  71.36 
 
 		 398 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  71.61 
 
 		 394 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  70.26 
 
 		 395 aa  542  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  70.08 
 
 		 394 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  71.03 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  69.74 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  69.57 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  69.57 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  66.67 
 
 		 394 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  65.38 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  66.41 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  65.9 
 
 		 394 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  65.38 
 
 		 394 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  64.1 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  62.92 
 
 		 392 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  61.19 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  61.19 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  61.44 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  63.85 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  62.56 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  63.08 
 
 		 394 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  62.56 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  62.56 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  62.56 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  61.79 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  64.87 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  62.76 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  64.87 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  64.62 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  64.87 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  63.75 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  62.31 
 
 		 395 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  63.33 
 
 		 394 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  63.24 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  62.98 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  62.72 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  62.72 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  62.72 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  62.21 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  65.04 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  59.23 
 
 		 393 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  58.87 
 
 		 396 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  62.31 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  59.38 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  59.59 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  58.46 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  58.87 
 
 		 396 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  58.46 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  58.61 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  57.95 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  61.79 
 
 		 400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  61.54 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  57.07 
 
 		 393 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  57.29 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  56.78 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  58.46 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  58.72 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  56.89 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  55.53 
 
 		 391 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  56.67 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 394 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  47.69 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 		 392 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  47.69 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 		 390 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 		 392 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  47.42 
 
 		 408 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 		 392 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  48.84 
 
 		 394 aa  360  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 392 aa  359  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  47.21 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  47.58 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>