More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1536 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
396 aa  799    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  78.37 
 
 
394 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  72.41 
 
 
421 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  74.05 
 
 
398 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  75.51 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  73.54 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  73.21 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  72.45 
 
 
395 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  72.52 
 
 
394 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  72.77 
 
 
394 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  67.51 
 
 
394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  67.51 
 
 
394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  73.28 
 
 
394 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  67.01 
 
 
394 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  65.48 
 
 
394 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  68.78 
 
 
394 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  69.04 
 
 
395 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  66.75 
 
 
394 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  68.78 
 
 
394 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  66.5 
 
 
394 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  68.53 
 
 
394 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  68.53 
 
 
394 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  67.77 
 
 
394 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  65.9 
 
 
397 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  64.72 
 
 
394 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  66.16 
 
 
397 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  66.16 
 
 
397 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  66.16 
 
 
397 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  65.9 
 
 
397 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  64.97 
 
 
394 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  65.9 
 
 
397 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  63.8 
 
 
427 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  63.96 
 
 
394 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  63.71 
 
 
394 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  63.96 
 
 
394 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  64.05 
 
 
427 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  64.05 
 
 
427 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  63.96 
 
 
394 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  65.14 
 
 
409 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  63.71 
 
 
394 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  63.89 
 
 
396 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  63.94 
 
 
392 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  64.97 
 
 
395 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  60.87 
 
 
398 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  62.37 
 
 
395 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  60.86 
 
 
396 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  63.17 
 
 
392 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  64.63 
 
 
395 aa  488  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  61.79 
 
 
393 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  63.17 
 
 
389 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 
396 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  60.15 
 
 
394 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  60.15 
 
 
394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  62.18 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  60.97 
 
 
393 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  61.89 
 
 
393 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  63.17 
 
 
400 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  62.4 
 
 
389 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  56.92 
 
 
393 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  59.08 
 
 
391 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  60.31 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  59.95 
 
 
395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  59.03 
 
 
393 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  58.82 
 
 
397 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  59.39 
 
 
394 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  57.8 
 
 
391 aa  434  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  52.15 
 
 
402 aa  398  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  381  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 
393 aa  378  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
392 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  51.65 
 
 
397 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
394 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
394 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
394 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
392 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
392 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 
391 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
394 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
392 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 
390 aa  362  8e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.38 
 
 
396 aa  362  9e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 
392 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 
392 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 
395 aa  358  6e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
391 aa  358  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  47.99 
 
 
393 aa  358  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 
392 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  47.01 
 
 
400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.12 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2706  acetyl-CoA acetyltransferases  47.97 
 
 
394 aa  356  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>