More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0022 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  99.23 
 
 
389 aa  766    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  96.66 
 
 
389 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  100 
 
 
400 aa  793    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  73.64 
 
 
394 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  69.82 
 
 
391 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  70.77 
 
 
393 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  68.54 
 
 
391 aa  534  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  67.26 
 
 
392 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  65.73 
 
 
394 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  66.24 
 
 
394 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  62.15 
 
 
394 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  63.17 
 
 
396 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  64.96 
 
 
394 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  62.15 
 
 
394 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  65.22 
 
 
394 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  62.66 
 
 
394 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  63.59 
 
 
394 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  60.61 
 
 
394 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  59.95 
 
 
427 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  61.83 
 
 
396 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  61.79 
 
 
421 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  63.8 
 
 
398 aa  471  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  60.1 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  60.1 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  60.36 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  60.36 
 
 
394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 
395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  59.45 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  59.7 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  60.1 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  64.03 
 
 
395 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  59.59 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  60.1 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  63.27 
 
 
395 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  59.44 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  62.4 
 
 
394 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  58.46 
 
 
396 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  62.4 
 
 
394 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  59.59 
 
 
394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  62.92 
 
 
395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  61.13 
 
 
395 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  61.07 
 
 
393 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  60.61 
 
 
394 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  60.61 
 
 
394 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  59.08 
 
 
394 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  59.44 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  58.27 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  58.75 
 
 
409 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  59.49 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  59.24 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  59.08 
 
 
393 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  59.85 
 
 
394 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  59.24 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  59.24 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  59.24 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  59.49 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  58.72 
 
 
396 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  57.07 
 
 
393 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  56.12 
 
 
393 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  59.59 
 
 
395 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  57.4 
 
 
393 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  57.07 
 
 
393 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  53.96 
 
 
394 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  53.71 
 
 
394 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  57.4 
 
 
397 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  55.7 
 
 
395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  55.5 
 
 
395 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
393 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 
402 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
392 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.88 
 
 
392 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
394 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
392 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
392 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  55.03 
 
 
395 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
393 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
392 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
393 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>