More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0433 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  82.44 
 
 
393 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
393 aa  789    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1520  thiolase  81.68 
 
 
393 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  78.15 
 
 
397 aa  621  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 
396 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  52.94 
 
 
394 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  52.69 
 
 
394 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  53.21 
 
 
394 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  52.69 
 
 
394 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  52.64 
 
 
395 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  52.17 
 
 
394 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
396 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  50.38 
 
 
394 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  51.41 
 
 
394 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  51.66 
 
 
394 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  51.28 
 
 
394 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  51.41 
 
 
394 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  51.41 
 
 
394 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  51.66 
 
 
394 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  51.41 
 
 
394 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 
392 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  51.41 
 
 
427 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  52.17 
 
 
398 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  51.15 
 
 
427 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  51.15 
 
 
394 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  50.89 
 
 
396 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  51.41 
 
 
427 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
393 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  50.51 
 
 
394 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  50.38 
 
 
394 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  50.26 
 
 
394 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  50.26 
 
 
394 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  51.91 
 
 
394 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.23 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  49.87 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  50.13 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  51.65 
 
 
394 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  51.41 
 
 
395 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 
394 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  49.1 
 
 
395 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  51.4 
 
 
393 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  51.4 
 
 
394 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.4 
 
 
391 aa  353  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  50.9 
 
 
395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  47.84 
 
 
394 aa  350  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
398 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 
394 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 
394 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 
394 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 
394 aa  347  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  51.67 
 
 
389 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
390 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  52.54 
 
 
394 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  48.86 
 
 
397 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  48.86 
 
 
397 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  50.51 
 
 
395 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  48.61 
 
 
409 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  48.45 
 
 
421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  48.86 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  48.61 
 
 
397 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  48.61 
 
 
397 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  49.74 
 
 
393 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  44.76 
 
 
393 aa  341  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  47.75 
 
 
402 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  46.58 
 
 
394 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  48.35 
 
 
397 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  46.58 
 
 
398 aa  338  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  46.58 
 
 
394 aa  338  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  43.85 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3058  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 
394 aa  337  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
392 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 
398 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
392 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  47.15 
 
 
392 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
392 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  50.39 
 
 
394 aa  334  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  45.95 
 
 
393 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 
390 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 
392 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  49.36 
 
 
397 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  45.18 
 
 
392 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
392 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  49.23 
 
 
395 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  47.56 
 
 
391 aa  332  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  45.94 
 
 
392 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  45.69 
 
 
392 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
395 aa  331  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  45.05 
 
 
393 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  45.05 
 
 
393 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
393 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  45.9 
 
 
391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  43.99 
 
 
393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 
392 aa  329  6e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>