More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4348 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  94.19 
 
 		 396 aa  764    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 396 aa  801    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  77.24 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  69.39 
 
 		 394 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  68.88 
 
 		 394 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  68.37 
 
 		 394 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  67.86 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  68.11 
 
 		 394 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  68.11 
 
 		 394 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  67.86 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  67.35 
 
 		 394 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  69.04 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  67.09 
 
 		 394 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 394 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  67.35 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  66.58 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  66.5 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  66.33 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  65.82 
 
 		 395 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  65.99 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  65.99 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  66.07 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  65.99 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  65.99 
 
 		 397 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  65.99 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  65.99 
 
 		 397 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  65.56 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  65.56 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  62.4 
 
 		 394 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.48 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  64.1 
 
 		 393 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  62.56 
 
 		 398 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  63.64 
 
 		 397 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  58.87 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  61.64 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  61.79 
 
 		 392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  59.74 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  61.22 
 
 		 395 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  61.48 
 
 		 395 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  62.5 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  61.28 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  59.13 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  58.97 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  57.95 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  58.97 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  58.16 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  58.16 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  58.97 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  59.44 
 
 		 395 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  58.97 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  58.72 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  56.78 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  56.92 
 
 		 391 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  55.5 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  58.82 
 
 		 389 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  57.33 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  58.72 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  56.67 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  56.89 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  57.29 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  56.42 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  54.36 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3058  acetyl-CoA acetyltransferase  52.05 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4738  thiolase  50.76 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.25 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1953  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0102019  normal  0.550682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>