More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5309 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 398 aa  791    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  62.4 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  62.15 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  65.56 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  61.13 
 
 		 394 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  63.61 
 
 		 392 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  61.89 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  62.15 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  61.38 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  62.34 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  61.13 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60.87 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 394 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  61.38 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  62.24 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  62.24 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  62.24 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  61.73 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  61.48 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  61.48 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  61.48 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  62.15 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  60.05 
 
 		 421 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  60.36 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  60.87 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  60.1 
 
 		 394 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  60.1 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  59.85 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  59.59 
 
 		 394 aa  461  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  59.59 
 
 		 394 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  60.36 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  60.87 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  60.87 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  60.61 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  59.8 
 
 		 392 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  60.97 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  61.64 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  59.34 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  59.03 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  60.36 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  59.85 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  61.13 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  58.93 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  56.49 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  56.74 
 
 		 391 aa  438  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  57.4 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  58.27 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  57.76 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  53.71 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  52.69 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  55.87 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  54.45 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  55.24 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  52.82 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  52.94 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  52.69 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  53.02 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 		 391 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  47.58 
 
 		 391 aa  359  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  46.82 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  48.62 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 		 393 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  50.26 
 
 		 397 aa  349  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 394 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 		 393 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0080  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>