More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4142 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 
397 aa  784    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  80.46 
 
 
393 aa  638    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  78.15 
 
 
393 aa  621  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1520  thiolase  77.52 
 
 
393 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128139  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  52.79 
 
 
394 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.65 
 
 
396 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
396 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
393 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  50.87 
 
 
398 aa  362  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  49.23 
 
 
394 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  49.23 
 
 
394 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
392 aa  358  6e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 
393 aa  353  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  50.26 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
394 aa  353  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  48.72 
 
 
394 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  49.74 
 
 
394 aa  353  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  48.97 
 
 
394 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
395 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  48.72 
 
 
394 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  48.49 
 
 
427 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  48.49 
 
 
427 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  45.06 
 
 
392 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
396 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  48.24 
 
 
427 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  48.97 
 
 
394 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  48.97 
 
 
394 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  48.97 
 
 
394 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
394 aa  349  4e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
398 aa  349  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
394 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
394 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
394 aa  349  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  48.72 
 
 
394 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  48.35 
 
 
421 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  52.96 
 
 
392 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  48.21 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
394 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  48.97 
 
 
394 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  50.25 
 
 
395 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
394 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  47.95 
 
 
394 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  47.95 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  47.81 
 
 
392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  49.75 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.13 
 
 
391 aa  343  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  47.34 
 
 
394 aa  343  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  47.34 
 
 
394 aa  343  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
398 aa  341  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  47.18 
 
 
394 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  49.74 
 
 
393 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  49.36 
 
 
394 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  49.36 
 
 
394 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  48.01 
 
 
409 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  49.1 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  46.92 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  46.79 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  49.49 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
393 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  49.87 
 
 
389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.94 
 
 
393 aa  336  5e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 
392 aa  335  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.09 
 
 
396 aa  335  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
393 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
393 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 
402 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 
398 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
393 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  45.74 
 
 
391 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  48.21 
 
 
397 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
393 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  47.44 
 
 
394 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
393 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  47.95 
 
 
397 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
393 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
393 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
393 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  48.45 
 
 
393 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
390 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.56 
 
 
398 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  44.87 
 
 
392 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
393 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  48.59 
 
 
391 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
393 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.3 
 
 
398 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
393 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
391 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  47.92 
 
 
392 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  47.69 
 
 
397 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  47.69 
 
 
397 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
391 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  47.95 
 
 
397 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.78 
 
 
396 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  44.99 
 
 
393 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  47.69 
 
 
397 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>