More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5531 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  83.16 
 
 		 427 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  83.42 
 
 		 394 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  83.67 
 
 		 394 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  97.23 
 
 		 397 aa  755    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  83.42 
 
 		 427 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  83.16 
 
 		 394 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  96.98 
 
 		 397 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  83.25 
 
 		 396 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  83.67 
 
 		 394 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  83.67 
 
 		 394 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  83.42 
 
 		 394 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  100 
 
 		 397 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  82.4 
 
 		 394 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  83.67 
 
 		 427 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  84.44 
 
 		 394 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  94.96 
 
 		 409 aa  737    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  78.88 
 
 		 394 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  96.98 
 
 		 397 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  78.12 
 
 		 394 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  78.12 
 
 		 394 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  99.5 
 
 		 397 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  96.98 
 
 		 397 aa  752    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  76.84 
 
 		 394 aa  630  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  78.06 
 
 		 394 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  80.15 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  76.08 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  76.79 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  75.06 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  76.28 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  76.34 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  76.34 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  66.16 
 
 		 396 aa  544  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  67.35 
 
 		 394 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  67.6 
 
 		 395 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  70.23 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  68.62 
 
 		 395 aa  524  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  66.33 
 
 		 398 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 395 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  68.62 
 
 		 395 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 		 398 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  65.99 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  63.48 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  63.22 
 
 		 394 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  62.98 
 
 		 421 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  62.97 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  63.68 
 
 		 392 aa  500  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  63.48 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 		 392 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  64.54 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  60.87 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  62.94 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  61.54 
 
 		 393 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  59.54 
 
 		 393 aa  471  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  59.95 
 
 		 389 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  60.71 
 
 		 394 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  57.8 
 
 		 391 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  57.51 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  59.34 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  57.25 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  58.88 
 
 		 393 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  59.24 
 
 		 400 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  57.4 
 
 		 395 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  58.67 
 
 		 389 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  57.65 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  56.52 
 
 		 393 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  56.6 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  52.02 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  51.51 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.89 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.01 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 		 393 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>