More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0040 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0040  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 423 aa  843    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.632212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0797  acetyl-CoA acetyltransferases  67.23 
 
 		 416 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0749989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3113  Acetyl-CoA C-acyltransferase  66.83 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601433  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0272  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  66.5 
 
 		 416 aa  494  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14260  beta-ketothiolase  59.71 
 
 		 416 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2050  acetyl-CoA acetyltransferase  56.31 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2491  acetyl-CoA acetyltransferase  54.88 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2940  thiolase family protein  52.9 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2403  acetyl-CoA acetyltransferase  56.31 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3355  beta-ketothiolase  57.54 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2725  thiolase  52.16 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378058  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  44.96 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0068  acetyl-CoA acetyltransferase  45.07 
 
 		 398 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0080  acetyl-CoA acetyltransferase  45.07 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45947  predicted protein  43.28 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  42.01 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0064  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 		 402 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0062  acetyl-CoA acetyltransferase  45.07 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.77 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  38.59 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  40.39 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  39.76 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  40.64 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  42.32 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  39.95 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  38.69 
 
 		 393 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  38.07 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  42.22 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  40.24 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 391 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  40.29 
 
 		 392 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  39.32 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.9 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  39.81 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.23 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  39.66 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  36.27 
 
 		 391 aa  249  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  38.46 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  39.08 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0649  acetyl-CoA acetyltransferase  38.33 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.9 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  40.24 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  39.95 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.98 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  40.1 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  40.1 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  41.2 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  37.35 
 
 		 393 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  39.95 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  38.7 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  39.71 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.14 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  37.29 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  39.01 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1071  acetyl-CoA acetyltransferase  37.86 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.595255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  39.71 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  40.64 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2401  acetyl-CoA acetyltransferases  37.16 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.412675  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.24 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  41.3 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  42.12 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  38.81 
 
 		 393 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.05 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.09 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  39.13 
 
 		 393 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  38.52 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  37.9 
 
 		 398 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.37 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.24 
 
 		 400 aa  242  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  41.13 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0029  acetyl-CoA acetyltransferase  38.85 
 
 		 402 aa  242  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.471693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  39.13 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  40 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  38.05 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.71 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2706  acetyl-CoA acetyltransferases  38.92 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  39.56 
 
 		 389 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  37.23 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.72 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.77 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  38.52 
 
 		 392 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  39.22 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  41.28 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  42.22 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  38.48 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.13 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.61 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  38.5 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  39.46 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  39.46 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>