More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3355 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3355  beta-ketothiolase  100 
 
 		 396 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2403  acetyl-CoA acetyltransferase  98.99 
 
 		 413 aa  776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2050  acetyl-CoA acetyltransferase  90.15 
 
 		 413 aa  685    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2940  thiolase family protein  72.08 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14260  beta-ketothiolase  67.85 
 
 		 416 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00172773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2725  thiolase  68.42 
 
 		 420 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378058  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0797  acetyl-CoA acetyltransferases  58.59 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0749989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3113  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.01 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601433  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0272  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59.75 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0040  acetyl-CoA acetyltransferase  57.54 
 
 		 423 aa  401  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.632212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2491  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  43.77 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45947  predicted protein  42.11 
 
 		 403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0080  acetyl-CoA acetyltransferase  40.86 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0068  acetyl-CoA acetyltransferase  40.36 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  38.99 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  40.66 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  38.83 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  40.1 
 
 		 407 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0062  acetyl-CoA acetyltransferase  41.67 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  38.58 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  39.2 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0064  acetyl-CoA acetyltransferase  40.2 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  40.15 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.59 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  40.2 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  36.68 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  41.85 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  38.38 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  36.48 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  36.25 
 
 		 398 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.35 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  41.35 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  40.05 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  40.64 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0529  Acetyl-CoA acetyltransferase  34.43 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.73 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1805  acetyl-CoA acetyltransferase  39.22 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.66 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1758  acetyl-CoA acetyltransferase  39.22 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  36 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  42.28 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  38.38 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.27 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.85 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  39.69 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  40.65 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.05 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  40.2 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  40.65 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  36.05 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  40.65 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  40.65 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  40.65 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  38.65 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  38.48 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  37.91 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.9 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.15 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.85 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  38.69 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  38.78 
 
 		 405 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.3 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  38.4 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2991  acetyl-CoA acetyltransferase  40.4 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00959201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  40.66 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  38.1 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  38.5 
 
 		 392 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  37.75 
 
 		 392 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  39.1 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  37.69 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  40.4 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  37.8 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  40.4 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  36.11 
 
 		 393 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.88 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.84 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.81 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.94 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  40.2 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  36.22 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  38.85 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  39.34 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  36.22 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>