More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0272 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0272  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 		 416 aa  843    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0797  acetyl-CoA acetyltransferases  82.81 
 
 		 416 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0749989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3113  Acetyl-CoA C-acyltransferase  84.26 
 
 		 416 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601433  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0040  acetyl-CoA acetyltransferase  66.5 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.632212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14260  beta-ketothiolase  58.92 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2050  acetyl-CoA acetyltransferase  57.87 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2403  acetyl-CoA acetyltransferase  57.87 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3355  beta-ketothiolase  59.75 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2940  thiolase family protein  52.8 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2491  acetyl-CoA acetyltransferase  54.46 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2725  thiolase  51.9 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378058  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  46.4 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0068  acetyl-CoA acetyltransferase  40.55 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0080  acetyl-CoA acetyltransferase  40.55 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0064  acetyl-CoA acetyltransferase  41.19 
 
 		 402 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  40.84 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  40.1 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  41.08 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45947  predicted protein  40.49 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  40.24 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  39.01 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  40.35 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0062  acetyl-CoA acetyltransferase  40.59 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  39.26 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  38.63 
 
 		 392 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  38.08 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  38.3 
 
 		 411 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  39.55 
 
 		 393 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  38.23 
 
 		 391 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  37.97 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  39.76 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.84 
 
 		 396 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  39.56 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  39.65 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  38.77 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  39.27 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  36.3 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  37.72 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  39.01 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  38.15 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.97 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  38.83 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  37.72 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  39.71 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  37.22 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  36.06 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.71 
 
 		 401 aa  245  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  39.02 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  39.02 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  37.93 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  37.53 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  38.78 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  37.9 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  37.81 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  37.62 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  37.9 
 
 		 393 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  36.79 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  36.79 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  36.79 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  38.57 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  37.28 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  38.57 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  38.54 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  36.79 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  37.9 
 
 		 393 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  37.93 
 
 		 392 aa  243  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  38.54 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  37.16 
 
 		 392 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  36.54 
 
 		 427 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  37.32 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  36.54 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  37.07 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  37.84 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.53 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  38.1 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  37.22 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.98 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  37.53 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2401  acetyl-CoA acetyltransferases  36.86 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.412675  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  36.3 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.42 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  37.78 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  38.08 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  37.71 
 
 		 392 aa  240  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  37.28 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  38.24 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>