More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1778 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1778  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
405 aa  827    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3545  acetyl-CoA acetyltransferase  60.1 
 
 
393 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  56.35 
 
 
393 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
392 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  53.59 
 
 
393 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  47.33 
 
 
394 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 
391 aa  360  3e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0789  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.21 
 
 
403 aa  356  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 
391 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
391 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
391 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
391 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 
391 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
391 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
391 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  47.58 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.21 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
391 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
392 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
392 aa  352  7e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
391 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
394 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
394 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  48.98 
 
 
394 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
394 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
394 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
392 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.95 
 
 
396 aa  349  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
390 aa  349  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
394 aa  348  7e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0675  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.38 
 
 
402 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  48.47 
 
 
394 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  48.47 
 
 
394 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
392 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
393 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
392 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.08 
 
 
393 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
393 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  48.47 
 
 
394 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
392 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
395 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  48.03 
 
 
392 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3171  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
392 aa  342  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
393 aa  342  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 
390 aa  342  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  47.69 
 
 
394 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  48.09 
 
 
392 aa  342  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
391 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
391 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
392 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 
398 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 
394 aa  339  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  46.82 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  47.77 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0671  acetyl-CoA acetyltransferase  43.93 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000276078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  47.77 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  48.29 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 
392 aa  336  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
393 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
394 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
394 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.85 
 
 
390 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 
390 aa  335  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
393 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.57 
 
 
390 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  47.58 
 
 
394 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
392 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
393 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
393 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  47.21 
 
 
395 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  46.41 
 
 
394 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
393 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
393 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.83 
 
 
390 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 
401 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
393 aa  332  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2401  acetyl-CoA acetyltransferases  45.52 
 
 
408 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.412675  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  46.82 
 
 
394 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  47.07 
 
 
394 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 
391 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
393 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
393 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  45.8 
 
 
394 aa  329  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  44.99 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  44.76 
 
 
392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
391 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 
393 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0308  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.45 
 
 
402 aa  329  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.23 
 
 
391 aa  328  8e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>