More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0308 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0308  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
402 aa  823    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0789  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  63.75 
 
 
403 aa  523  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0675  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.25 
 
 
402 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 
374 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  54.16 
 
 
393 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
393 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3545  acetyl-CoA acetyltransferase  47.58 
 
 
393 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
391 aa  341  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.23 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  46.23 
 
 
393 aa  336  5e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.97 
 
 
396 aa  336  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  45.14 
 
 
394 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  45.78 
 
 
394 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
394 aa  329  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
394 aa  329  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1778  acetyl-CoA acetyltransferase  45.45 
 
 
405 aa  329  7e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  44.86 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
392 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  44.61 
 
 
392 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.78 
 
 
393 aa  322  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  45.23 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  44.28 
 
 
393 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  44.28 
 
 
393 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
392 aa  319  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
394 aa  318  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
392 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 
392 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
391 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
392 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 
391 aa  316  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 
391 aa  316  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  43.61 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  43.83 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  43.32 
 
 
395 aa  312  7.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  43.77 
 
 
391 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.08 
 
 
396 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  41.79 
 
 
393 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  43.15 
 
 
393 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  44.5 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
394 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
427 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
393 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  45.45 
 
 
393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  42.36 
 
 
392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
427 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 
392 aa  308  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
390 aa  308  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  43.29 
 
 
408 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  43.07 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  43.04 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  43.36 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  44.62 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  43.07 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  44.1 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  44.1 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  44.1 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 
393 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 
393 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  42.56 
 
 
393 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  42.57 
 
 
394 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  43.65 
 
 
393 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 
394 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  43.32 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  43.85 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  42.13 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  43.65 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  42.46 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  43.08 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  42 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>