More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1892 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
374 aa  768    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0789  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  69.46 
 
 
403 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0675  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  64.64 
 
 
402 aa  484  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0308  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.73 
 
 
402 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  55.71 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  54.04 
 
 
392 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  50.54 
 
 
393 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3545  acetyl-CoA acetyltransferase  51.81 
 
 
393 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  49.45 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.28 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.6 
 
 
396 aa  318  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  45.6 
 
 
394 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1778  acetyl-CoA acetyltransferase  47.49 
 
 
405 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  46.2 
 
 
391 aa  315  7e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  45.88 
 
 
395 aa  315  7e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  46.85 
 
 
392 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  43.78 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  45.4 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  42.23 
 
 
394 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
391 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  42.7 
 
 
393 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  42.7 
 
 
393 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  46.34 
 
 
393 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  42.47 
 
 
393 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  43.85 
 
 
393 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  42.58 
 
 
392 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  44.81 
 
 
396 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  43.41 
 
 
392 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
391 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  42.19 
 
 
393 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  45.63 
 
 
395 aa  299  6e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  43.41 
 
 
392 aa  299  6e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  45.83 
 
 
398 aa  298  7e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
391 aa  299  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  45.25 
 
 
400 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 
391 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 
391 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 
391 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 
391 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 
391 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
391 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 
391 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  43.75 
 
 
394 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  43.21 
 
 
394 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  42.62 
 
 
392 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  43.21 
 
 
394 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  41.78 
 
 
392 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.2 
 
 
396 aa  292  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  43.29 
 
 
392 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  41.78 
 
 
392 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  46.71 
 
 
409 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  41.69 
 
 
393 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  43.36 
 
 
395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  46.71 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  44.51 
 
 
393 aa  289  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.57 
 
 
396 aa  289  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  44.72 
 
 
396 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  43.38 
 
 
392 aa  289  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  46.71 
 
 
397 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  46.11 
 
 
397 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3171  acetyl-CoA acetyltransferase  43.38 
 
 
392 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 
393 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  43.29 
 
 
392 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  40.95 
 
 
392 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  46.71 
 
 
397 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  45.41 
 
 
394 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  43.44 
 
 
394 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  43.44 
 
 
394 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  41.42 
 
 
393 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  41.42 
 
 
393 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  43.44 
 
 
394 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  42.06 
 
 
393 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  43.44 
 
 
427 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  41.42 
 
 
393 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  41.42 
 
 
393 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  43.44 
 
 
427 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  41.42 
 
 
393 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  41.42 
 
 
393 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  41.42 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  43.21 
 
 
394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  43.44 
 
 
427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  41.71 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  41.78 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  41.27 
 
 
393 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  43.17 
 
 
394 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  45.81 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  45.81 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  43.44 
 
 
394 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  45.14 
 
 
394 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3735  acetyl-CoA acetyltransferase  43.82 
 
 
391 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
393 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  43.45 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  41.99 
 
 
395 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  42.39 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  40.95 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  43.45 
 
 
392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  41.58 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0671  acetyl-CoA acetyltransferase  43.21 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000276078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>