More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0789 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0789  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
403 aa  822    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  69.46 
 
 
374 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0675  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  66.42 
 
 
402 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0308  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  63.75 
 
 
402 aa  523  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  52.78 
 
 
393 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3545  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
393 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1778  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
405 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.1 
 
 
396 aa  353  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.1 
 
 
396 aa  350  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  47.42 
 
 
391 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 
393 aa  341  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
392 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.85 
 
 
393 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
392 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
392 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  45.34 
 
 
394 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  44.73 
 
 
392 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  44.99 
 
 
393 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
392 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  43.36 
 
 
402 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
392 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 
391 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
395 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  44.97 
 
 
395 aa  323  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  45.62 
 
 
398 aa  323  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 
391 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  44.73 
 
 
393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 
391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 
391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 
391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 
391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 
391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  43.99 
 
 
394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 
391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  42.03 
 
 
394 aa  319  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
394 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
394 aa  319  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 
391 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  43.11 
 
 
393 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
393 aa  319  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  42.03 
 
 
393 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  42.57 
 
 
399 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 
393 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  42.03 
 
 
393 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  42.78 
 
 
391 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
393 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  44.59 
 
 
390 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
398 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  44.72 
 
 
392 aa  317  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
393 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  43.92 
 
 
395 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  43.86 
 
 
393 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.81 
 
 
391 aa  315  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
393 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
393 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0522  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.061167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  41.96 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  43.42 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  43.69 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  43.69 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  44.59 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  43.19 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  43.19 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  45.1 
 
 
392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  43.19 
 
 
393 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  43.39 
 
 
401 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
393 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
393 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0515  acetyl-CoA acetyltransferase  42.71 
 
 
403 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  43.47 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  43.47 
 
 
394 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  43.94 
 
 
392 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2401  acetyl-CoA acetyltransferases  43.56 
 
 
408 aa  309  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.412675  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 
392 aa  309  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
393 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
393 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
393 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
393 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  43.19 
 
 
392 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
393 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
393 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
393 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
393 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
393 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 
393 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  41.96 
 
 
393 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 
394 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>