239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6539 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  100 
 
 		 226 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  45.79 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  43.78 
 
 		 231 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  44.98 
 
 		 231 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  42.4 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  41.94 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  40.18 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  40.18 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  40.18 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  40.18 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  38.89 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  39.73 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  39.62 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  39.17 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  37.09 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  40.76 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  40.76 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  40.76 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  40.76 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  40.76 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  40.76 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  40.76 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  40.76 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  40.19 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  36.7 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  35.32 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  38.79 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  38.39 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  38.39 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  38.86 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  37.91 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  38.39 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  37.91 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  37.91 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  40.34 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  34.43 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  39.53 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  35.35 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  34.42 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  36.36 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  34.65 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  40.74 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  40.74 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  34.16 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  36.82 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  35.92 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  39.45 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  36.36 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  36.36 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  36.36 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  36.36 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  29.82 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  35.92 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  35.92 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  30.84 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  30.84 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  32.73 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  30.37 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  30.37 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  30.37 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  30.37 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  30.37 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  30.48 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  30.37 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  35.51 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  29.91 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  29.46 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  29.91 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  38.07 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  35.02 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  31.68 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  31.68 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  31.43 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  30.63 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  31.31 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  31.31 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  31.68 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  30.57 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  35 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  30.36 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  34.5 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  30.81 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  30.69 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  30.81 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  34 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  30.3 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  33.33 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  33.33 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1229  LrgB-like family protein  25.93 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  29.82 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  33.67 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  32.68 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  30.81 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>