More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5553 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0130  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.48 
 
 		 670 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2645  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.69 
 
 		 666 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.727067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19740  ATP synthase F1, alpha subunit  69.79 
 
 		 513 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2779  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.35 
 
 		 504 aa  682    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.470369 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1048  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.69 
 
 		 664 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0426  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.68 
 
 		 556 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1122  ATP synthase F1, alpha subunit  69.09 
 
 		 525 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5553  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 522 aa  1030    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1885  F0F1 ATP synthase subunit alpha  80.51 
 
 		 510 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879266  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0043  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.98 
 
 		 530 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2787  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.69 
 
 		 670 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0154  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.48 
 
 		 670 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.48 
 
 		 670 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1050  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 		 517 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4103  ATP synthase F1, alpha subunit  65.99 
 
 		 497 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0134913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3935  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  65.99 
 
 		 497 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455536  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.35 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.25 
 
 		 571 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.18 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  51.77 
 
 		 503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.54 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.17 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.68 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.01 
 
 		 528 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.86 
 
 		 507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.45 
 
 		 503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.05 
 
 		 519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.97 
 
 		 510 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  45.55 
 
 		 541 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  53.32 
 
 		 585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.45 
 
 		 503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  47.87 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2707  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.85 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.555137  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 		 502 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.43 
 
 		 522 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.35 
 
 		 511 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.44 
 
 		 534 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  46.99 
 
 		 508 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.49 
 
 		 503 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.34 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.78 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.51 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  47.39 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 509 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.64 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.02 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.18 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  46.88 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  48.52 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.04 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  50.45 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.41 
 
 		 520 aa  436  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.66 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 501 aa  435  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.12 
 
 		 522 aa  435  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.746829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.66 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.9 
 
 		 502 aa  435  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.87 
 
 		 503 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0082  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 525 aa  432  1e-120  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  51.07 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.35 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.16 
 
 		 512 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.12 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.12 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.36 
 
 		 509 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0147  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 797 aa  429  1e-119  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.85768  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.47 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.06 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.92 
 
 		 506 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  47.42 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.47 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  46.82 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.78 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>